CisBP motif

M07643_2.00

Source: CisBP

Download MEME Scan DNA CIS-BP v2 direct source

Sequence logo

Matrix 29 positions

Position	A	C	G	T
1	0.0000	0.0000	0.0000	1.0000
2	0.0000	0.0000	0.0000	1.0000
3	0.0000	0.0000	0.0000	1.0000
4	0.0000	1.0000	0.0000	0.0000
5	0.0000	0.1667	0.0000	0.8333
6	1.0000	0.0000	0.0000	0.0000
7	1.0000	0.0000	0.0000	0.0000
8	1.0000	0.0000	0.0000	0.0000
9	0.0000	0.0000	0.1667	0.8333
10	0.0000	0.1667	0.8333	0.0000
11	0.0000	0.6667	0.1667	0.1667
12	0.6667	0.0000	0.0000	0.3333
13	0.1667	0.0000	0.6667	0.1667
14	0.1667	0.6667	0.1667	0.0000
15	0.6667	0.0000	0.3333	0.0000
16	1.0000	0.0000	0.0000	0.0000
17	0.1667	0.6667	0.0000	0.1667
18	0.0000	0.6667	0.0000	0.3333
19	0.0000	0.0000	0.0000	1.0000
20	0.0000	0.3333	0.3333	0.3333
21	0.0000	0.0000	0.1667	0.8333
22	0.1667	0.1667	0.5000	0.1667
23	0.0000	0.0000	0.1667	0.8333
24	0.3333	0.0000	0.0000	0.6667
25	0.1667	0.5000	0.0000	0.3333
26	0.0000	0.1667	0.0000	0.8333
27	0.0000	0.0000	0.0000	1.0000
28	0.0000	0.6667	0.1667	0.1667
29	0.6667	0.0000	0.0000	0.3333

TFs using this motif 1 linked TF record

1 known/direct, 0 nearest-neighbor >70%, 0 nearest-neighbor 50–70%, 0 structure-derived. Showing all 1 assignment.

TF record	Motif assignment	Identity	PFAM Families
P17030	Known		zf-C2H2_4,C1_4,zf-C2H2,zf-C2H2_jaz,KRAB,zf-H2C2_2,CxxC_CxxC_SSSS,HTH_Tnp_ISL3,Yippee,Zn_Tnp_IS1595,C1_1,HTH_18,zf-C2H2_6